| 出场名单 | ||||
|---|---|---|---|---|
| 名次 | 国家/地区 | 运动员(号码) | 道次/出场顺序 | 成绩 |
| 1 |  美国 |
菲尔普斯 (294749) | 5 | 50.58 OR |
| 2 |  塞尔维亚 |
米洛拉德-查维奇 (353744) | 4 | 50.59 |
| 3 |  澳大利亚 |
劳特尔斯泰因 (485330) | 3 | 51.12 |
| 4 | 美国 |
伊恩-克罗克 (294745) | 6 | 51.13 |
| 5 |  肯尼亚 |
贾森-邓福德 (590356) | 2 | 51.47 |
| 6 |  日本 |
藤井拓郎 (721019) | 1 | 51.50 |
| 7 |  乌克兰 |
塞尔迪诺夫 (340479) | 7 | 51.59 |
| 8 |  巴布亚新几内亚 |
皮尼 (440025) | 8 | 51.86 |
说明：如有成绩为空、名次为空或为零的情况出现，则表示运动员/队弃权、未能完成比赛或遭到取消成绩处罚。
男子100米蝶泳奥运纪录:51秒25(保持者:菲尔普斯)
男子100米蝶泳世界纪录:50秒40(保持者:伊恩-克罗克尔)
